有機肥發酵罐主要是對畜禽糞便、廚余垃圾、生活污泥等廢棄物進行高溫好氧發酵，利用微生物的活性對廢棄物中的有機質進行生物分解，使其達到無害化、穩定化、減量化、資源化利用的一體化污泥處理設備。設備工作原理為將廢棄物(畜禽糞便、廚余垃圾、生活污泥等)、生物質(秸稈及鋸末等)以及回流物料按照一定比例混合均勻，使含水率達到設計要求60-65%后進入立體好氧系統，通過調節原料的水分、氧氣含量和溫度變化，使物料進行充分的好氧發酵分解，分解過程中釋放的熱量能夠使污泥自身溫度增高，溫度最高能夠達到80℃，污泥中的水分隨著溫度的上升被蒸發，部分有機物被分解，從而使堆體體積減小，到達廢棄物的減量化處理。有機肥發酵罐通過通風、充氧、攪拌等作用控制溫度在55~60℃之間，達到物料發酵處理的最佳溫度，在此溫度時，能夠使堆體中的大量病原菌和寄生蟲死亡，同時利用除臭系統對排放的氣體進行生物臭味，達到無害化處理的目的。高溫好氧發酵后得產品，可用于土壤改良、園林綠化、垃圾填埋覆蓋土等。

發酵罐的工作流程主要分為三個階段，升溫、恒溫、降溫。

原料進入發酵罐內，在短時間就可以快速升溫至65度左右。通過送風系統向發酵罐內部送風，保證原料充分與氧氣接觸，使物料快速充分的分解發酵。發酵過程中設備進入恒溫階段，持續發酵，同時除臭系統將發酵罐內的廢氣進行除臭并排出，達到無污染處理的目的。在高溫發酵過程中同時也將原料中含有的蟲卵，雜草種子，病原菌等有害物質殺死。發酵完成后進入降溫階段，通過出料口卸出物料進行下一道處理工序。